Jonas Baltrušaitis gimė 1959 m. balandžio 11 d. Kelmės rajone, Gudelių kaime. 1981 m. baigė LVKKI pradėjo dirbti Alytaus SRC lengvosios atletikos treneriu. Nuo 1988 m. dienos dirba Alytaus Adolfo Ramanausko – Vanago gimnazijoje ir antraeilėse pareigose Alytaus SRC. Nuo 1987 metų dirba su neįgaliais sportininkais, pagrindiniams startams ruošė paralimpietį Algirdą Tatulį kuris yra tapęs Atėnų paralimpinių žaidynių prizininku, pasaulio ir Europos čempionu, prizininku. 2008 m. pradėjo treniruoti Donatą Dundzį, kuris yra tapęs pasaulio IWAS žaidynių jaunimo nugalėtoju ir prizininku jaunimo, suaugusiųjų grupėse, 2017 m. pasaulio, 2018 m. ir 2021 m. Europos neįgaliųjų lengvosios atletikos čempionatų prizininku, 2021 m. debiutavo Tokijo paralimpinėse žaidynėse.